DICOMサーバに画像を転送するソフトは複数あります。
無料で利用できるものはバッチ処理などが多いのですが、少し工夫をすればGUIでフォルダー指定をして転送出来るソフトがあります。
GUIのフロントエンドを立ち上げてくれるので、フォルダー単位の転送には便利だと思います。
DisomSend
http://www.pacsmatt.com/progs/other/dicomsend
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